Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Utp11Q9CZJ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Utp11Q9CZJ1 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Utp11Q9CZJ1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms