Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ino80bQ99PT3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ino80bQ99PT3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ino80bQ99PT3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms