Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP8

Brap, BRCA1-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BrapQ99MP8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BrapQ99MP8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BrapQ99MP8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BrapQ99MP8 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BrapQ99MP8 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms