Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tm2d1Q99MB3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tm2d1Q99MB3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms