Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gdpd3Q99LY2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdpd3Q99LY2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms