Protein–RNA interactions for Protein: Q99K01

Pdxdc1, Pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdxdc1Q99K01 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pdxdc1Q99K01 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pdxdc1Q99K01 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pdxdc1Q99K01 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms