Protein–RNA interactions for Protein: Q91VA3

Capn8, Calpain-8, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn8Q91VA3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Capn8Q91VA3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn8Q91VA3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn8Q91VA3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn8Q91VA3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Capn8Q91VA3 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn8Q91VA3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn8Q91VA3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms