Protein–RNA interactions for Protein: Q91V61

Sfxn3, Sideroflexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn3Q91V61 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sfxn3Q91V61 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sfxn3Q91V61 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms