Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cacnb2Q8CC27 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cacnb2Q8CC27 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cacnb2Q8CC27 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.8 ms