Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI1

Trnp1, TMF-regulated nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnp1Q80ZI1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trnp1Q80ZI1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trnp1Q80ZI1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trnp1Q80ZI1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms