Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SugctQ7TNE1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SugctQ7TNE1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms