Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sbno2Q7TNB8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Sbno2Q7TNB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Sbno2Q7TNB8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms