Protein–RNA interactions for Protein: Q7M732

Rtl1, Retrotransposon-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl1Q7M732 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC38.14■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
Rtl1Q7M732 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
Rtl1Q7M732 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Rtl1Q7M732 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rtl1Q7M732 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms