Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tmed3Q78IS1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tmed3Q78IS1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmed3Q78IS1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1041 ms