Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB60

Bhlhb9, Protein BHLHb9, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhb9Q6PB60 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Bhlhb9Q6PB60 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Bhlhb9Q6PB60 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Bhlhb9Q6PB60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms