Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZM9

Hdac4, Histone deacetylase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac4Q6NZM9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Hdac4Q6NZM9 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hdac4Q6NZM9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hdac4Q6NZM9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hdac4Q6NZM9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms