Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVD9

Bfsp2, Phakinin, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bfsp2Q6NVD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Bfsp2Q6NVD9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Bfsp2Q6NVD9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Bfsp2Q6NVD9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms