Protein–RNA interactions for Protein: Q6J756

Capn11, Calpain-11, mousemouse

Predictions only

Length 714 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn11Q6J756 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Capn11Q6J756 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn11Q6J756 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn11Q6J756 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms