Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pram1Q6BCL1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pram1Q6BCL1 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pram1Q6BCL1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms