Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Lrrc8eQ66JT1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc8eQ66JT1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc8eQ66JT1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms