Protein–RNA interactions for Protein: Q61626

Grik5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik5Q61626 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Grik5Q61626 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Grik5Q61626 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Grik5Q61626 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms