Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinQ61043 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NinQ61043 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NinQ61043 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinQ61043 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinQ61043 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinQ61043 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinQ61043 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NinQ61043 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NinQ61043 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinQ61043 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NinQ61043 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NinQ61043 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NinQ61043 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NinQ61043 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NinQ61043 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NinQ61043 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinQ61043 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinQ61043 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinQ61043 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinQ61043 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinQ61043 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NinQ61043 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinQ61043 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NinQ61043 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NinQ61043 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinQ61043 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
NinQ61043 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NinQ61043 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NinQ61043 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinQ61043 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinQ61043 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinQ61043 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NinQ61043 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NinQ61043 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinQ61043 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NinQ61043 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinQ61043 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinQ61043 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinQ61043 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NinQ61043 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NinQ61043 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinQ61043 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinQ61043 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinQ61043 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinQ61043 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
NinQ61043 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinQ61043 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
NinQ61043 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms