Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCI0

Urgcp, Up-regulator of cell proliferation, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UrgcpQ5NCI0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
UrgcpQ5NCI0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UrgcpQ5NCI0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
UrgcpQ5NCI0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrgcpQ5NCI0 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
UrgcpQ5NCI0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
UrgcpQ5NCI0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms