Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Otol1Q4ZJM7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Otol1Q4ZJM7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Otol1Q4ZJM7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms