Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Clca4bQ3UW98 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clca4bQ3UW98 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clca4bQ3UW98 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms