Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Skap1Q3UUV5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Skap1Q3UUV5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Skap1Q3UUV5 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208.6 ms