Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH5

Sfswap, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 945 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfswapQ3USH5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SfswapQ3USH5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SfswapQ3USH5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SfswapQ3USH5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SfswapQ3USH5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms