Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Lmod2Q3UHZ5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.76
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Lmod2Q3UHZ5 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Lmod2Q3UHZ5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms