Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Nkx6-3Q3UHX8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Nkx6-3Q3UHX8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Nkx6-3Q3UHX8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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