Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDP0

Wdr41, WD repeat-containing protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr41Q3UDP0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdr41Q3UDP0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdr41Q3UDP0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdr41Q3UDP0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms