Protein–RNA interactions for Protein: Q0V8T9

Cntnap5a, Contactin-associated protein like 5-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap5aQ0V8T9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cntnap5aQ0V8T9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cntnap5aQ0V8T9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cntnap5aQ0V8T9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms