Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3.01
Col17a1Q07563 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Col17a1Q07563 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Col17a1Q07563 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Col17a1Q07563 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Col17a1Q07563 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
Col17a1Q07563 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Col17a1Q07563 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Col17a1Q07563 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Col17a1Q07563 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Col17a1Q07563 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Col17a1Q07563 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms