Protein–RNA interactions for Protein: Q05738

Sry, Sex-determining region Y protein, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SryQ05738 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SryQ05738 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SryQ05738 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SryQ05738 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SryQ05738 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SryQ05738 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SryQ05738 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SryQ05738 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SryQ05738 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SryQ05738 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SryQ05738 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SryQ05738 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SryQ05738 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SryQ05738 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SryQ05738 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SryQ05738 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SryQ05738 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SryQ05738 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SryQ05738 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SryQ05738 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SryQ05738 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SryQ05738 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SryQ05738 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SryQ05738 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SryQ05738 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SryQ05738 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SryQ05738 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SryQ05738 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SryQ05738 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SryQ05738 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SryQ05738 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SryQ05738 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SryQ05738 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SryQ05738 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SryQ05738 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SryQ05738 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SryQ05738 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms