Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Scg2Q03517 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Scg2Q03517 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Scg2Q03517 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms