Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddr1Q03146 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddr1Q03146 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddr1Q03146 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms