Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gbp10Q000W5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gbp10Q000W5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gbp10Q000W5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms