Protein–RNA interactions for Protein: P97473

Tarbp2, RISC-loading complex subunit TARBP2, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp2P97473 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Tarbp2P97473 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tarbp2P97473 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tarbp2P97473 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms