Protein–RNA interactions for Protein: P70414

Slc8a1, Sodium/calcium exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8a1P70414 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Slc8a1P70414 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc8a1P70414 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8a1P70414 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc8a1P70414 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms