Protein–RNA interactions for Protein: P63166

Sumo1, Small ubiquitin-related modifier 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumo1P63166 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sumo1P63166 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sumo1P63166 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sumo1P63166 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.4 ms