Protein–RNA interactions for Protein: P60954

Nol4, Nucleolar protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol4P60954 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nol4P60954 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol4P60954 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol4P60954 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol4P60954 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nol4P60954 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nol4P60954 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nol4P60954 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nol4P60954 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms