Protein–RNA interactions for Protein: P60324

Nanos3, Nanos homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nanos3P60324 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nanos3P60324 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nanos3P60324 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nanos3P60324 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.4 ms