Protein–RNA interactions for Protein: P59242

Cgn, Cingulin, mousemouse

Predictions only

Length 1,191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CgnP59242 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CgnP59242 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CgnP59242 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CgnP59242 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CgnP59242 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CgnP59242 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CgnP59242 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CgnP59242 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CgnP59242 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CgnP59242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CgnP59242 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CgnP59242 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CgnP59242 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CgnP59242 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CgnP59242 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CgnP59242 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CgnP59242 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CgnP59242 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CgnP59242 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CgnP59242 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CgnP59242 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CgnP59242 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CgnP59242 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CgnP59242 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CgnP59242 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CgnP59242 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CgnP59242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CgnP59242 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CgnP59242 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CgnP59242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CgnP59242 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CgnP59242 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CgnP59242 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CgnP59242 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CgnP59242 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CgnP59242 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CgnP59242 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CgnP59242 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms