Protein–RNA interactions for Protein: P50709

Defa11, Alpha-defensin 11 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa11P50709 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Defa11P50709 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa11P50709 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Defa11P50709 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Defa11P50709 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms