Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Rpl28P41105 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rpl28P41105 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rpl28P41105 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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