Protein–RNA interactions for Protein: P25916

Bmi1, Polycomb complex protein BMI-1, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmi1P25916 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Bmi1P25916 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmi1P25916 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmi1P25916 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms