Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Hoxb9P20615 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Hoxb9P20615 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Hoxb9P20615 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 675.3 ms