Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Hoxb1P17919 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxb1P17919 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxb1P17919 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms