Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
P06324 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06324 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06324 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06324 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06324 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06324 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
P06324 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
P06324 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P06324 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P06324 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P06324 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P06324 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P06324 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P06324 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06324 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06324 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06324 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06324 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P06324 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
P06324 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
P06324 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P06324 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms