Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lgals6O54891 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lgals6O54891 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms