Protein–RNA interactions for Protein: O35744

Chil3, Chitinase-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chil3O35744 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Chil3O35744 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Chil3O35744 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Chil3O35744 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms